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梯度PCR仪设置梯度问题

发布时间:2013-12-03 阅读:376

                  
  梯度PCR在变性、延伸均可设置梯度,那么如果在摸条件时三步均设置梯度?

  1.梯度PCR仪只是方便你寻找佳PCR退火温度,可能减少你做PCR的次数和时间。使用时和楼上的兄弟说的一样,但有一点需要说明一下,就是你所设的温度梯度并不能象楼上的兄弟所说的那么简单,设温度梯度时,行的温度是需要一个简单计算的。

  举例说明:比如一个12X8的96孔板,如果一共可设12个温度梯度,也就是说每8个孔是一个温度。你所设的初始温度是56度,你设的温度梯度是14,那你每一排的温度相差就是14/12。以些类推。

   2.一个很实用且简单的方法就是你将你所设计的引物我PCR产物放到Oligo中去评价,它会给你一个佳的退火温度和循环参数,这个温度实际上就和你通过梯度PCR摸索出来的退火温度几乎是一样的。

  3.以我的经验就直接用软件给出的退火温度就没有问题。

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